Counterfactual Modeling of Directional Cell Cell Influence in Spatial Transcriptomics
Ce papier propose un cadre de modélisation contrefactuel, agnostique aux paires ligand-récepteur, pour inférer des influences cellulaires directionnelles à partir de données de transcriptomique spatiale en quantifiant le déplacement de l'état cellulaire suite à une intervention simulée sur les voisins, et valide cette approche sur des tissus humains de cholangiocarcinome.